improve efficiency data module
This commit is contained in:
@@ -22,8 +22,9 @@ class EncX(nn.Module):
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super().__init__()
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self.net = nn.Sequential(
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nn.Linear(x_ch, hidden // 2),
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nn.SiLU(),
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nn.GELU(),
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||||
nn.Linear(hidden // 2, hidden),
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nn.GELU(),
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)
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def forward(self, x):
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@@ -35,8 +36,9 @@ class EncC(nn.Module):
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super().__init__()
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self.net = nn.Sequential(
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||||
nn.Linear(c_ch, hidden // 2),
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||||
nn.SiLU(),
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||||
nn.GELU(),
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||||
nn.Linear(hidden // 2, hidden),
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||||
nn.GELU(),
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||||
)
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def forward(self, c):
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@@ -48,8 +50,9 @@ class DecX(nn.Module):
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||||
super().__init__()
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||||
self.net = nn.Sequential(
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||||
nn.Linear(hidden, hidden // 2),
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||||
nn.SiLU(),
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||||
nn.GELU(),
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||||
nn.Linear(hidden // 2, out_ch),
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||||
nn.GELU(),
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)
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def forward(self, x):
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@@ -133,18 +136,18 @@ class ConditionalGNOBlock(MessagePassing):
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# Se edge_ch==0 useremo un coefficiente apprendibile globale
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self.edge_attr_net = nn.Sequential(
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nn.Linear(edge_ch, hidden_ch),
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nn.SiLU(),
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nn.GELU(),
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||||
nn.Linear(hidden_ch, hidden_ch // 2),
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||||
nn.SiLU(),
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||||
nn.GELU(),
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||||
nn.Linear(hidden_ch // 2, 1),
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||||
nn.Softplus(),
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)
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||||
# gating dalla condizione c_ij (restituisce scalar in (0,1))
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self.c_ij_net = nn.Sequential(
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nn.Linear(hidden_ch, hidden_ch),
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nn.SiLU(),
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||||
nn.GELU(),
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||||
nn.Linear(hidden_ch, hidden_ch // 2),
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||||
nn.SiLU(),
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||||
nn.GELU(),
|
||||
nn.Linear(hidden_ch // 2, 1),
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||||
nn.Sigmoid(),
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)
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@@ -152,13 +155,22 @@ class ConditionalGNOBlock(MessagePassing):
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# alpha per passo (clampato tramite sigmoid)
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self.alpha_net = nn.Sequential(
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nn.Linear(2 * hidden_ch, hidden_ch),
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||||
nn.SiLU(),
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||||
nn.GELU(),
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||||
nn.Linear(hidden_ch, hidden_ch // 2),
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||||
nn.SiLU(),
|
||||
nn.GELU(),
|
||||
nn.Linear(hidden_ch // 2, 1),
|
||||
nn.Sigmoid(),
|
||||
)
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||||
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||||
self.diff_net = nn.Sequential(
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||||
nn.Linear(hidden_ch, hidden_ch * 2),
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||||
nn.GELU(),
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||||
nn.Linear(hidden_ch * 2, hidden_ch**2),
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||||
nn.GELU(),
|
||||
nn.Linear(hidden_ch**2, hidden_ch),
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||||
nn.GELU(),
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||||
)
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# self.norm = nn.LayerNorm(hidden_ch)
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def forward(self, x, c, edge_index, edge_attr=None):
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@@ -171,43 +183,21 @@ class ConditionalGNOBlock(MessagePassing):
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m_ij = w_ij * (x_j - x_i) * c_gate_ij
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dove w_ij = softplus(edge_attr_net(edge_attr)) >= 0
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"""
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# 1) calcola c_ij e gating da c
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c_ij = 0.5 * (c_i + c_j) # [E, H]
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c_gate = self.c_ij_net(c_ij) # [E, 1] in (0,1)
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# 2) calcola peso scalare non-negativo per edge
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w_raw = self.edge_attr_net(edge_attr) # [E,1]
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# softplus -> peso >= 0; aggiungo epsilon per stabilità
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w = w_raw + 1e-12 # [E,1]
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# 3) messaggio base: differenza pesata
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w = w_raw + 1e-8
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diff = x_j - x_i # [E, H]
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m = w * diff # broadcast: [E,1] * [E,H] -> [E,H]
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# 4) applica gating dalla condizione
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m = w * self.diff_net(diff) + diff # [E,H]
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m = m * c_gate # [E,H]
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# Restituisco anche w (sfruttabile in update) — ma MessagePassing non ritorna extra,
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# così se vuoi degree-normalization devi calcolare i gradi prima di propagate.
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# Qui ritorno solo m: la normalizzazione per grado la faccio in update usando 'mean' aggr
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return m
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def update(self, aggr_out, x):
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"""
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aggr_out:
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- se aggr='sum': somma delle w_ij*(x_j-x_i) incoming
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- se aggr='mean': già normalizzato sul numero di vicini (ma non per somma dei pesi)
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||||
Qui normalizziamo implicitamente dividendo per (1 + |aggr_out|_norm) per stabilità,
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||||
e applichiamo il passo alpha.
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||||
TODO: doc
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"""
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||||
# aggr_out = self.norm(aggr_out) # stabilizza la scala
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||||
# alpha vettoriale/scalar: [N,1]
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||||
alpha = self.alpha_net(torch.cat([x, aggr_out], dim=-1)) # in (0,1)
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||||
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||||
alpha = self.alpha_net(torch.cat([x, aggr_out], dim=-1))
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x_new = x + alpha * aggr_out
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return x_new
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@@ -250,10 +240,10 @@ class GatingGNO(nn.Module):
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x_ = self.dec(x)
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plot_results_fn(x_, pos, 0, batch=batch)
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for _ in range(1, unrolling_steps + 1):
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for blk in self.blocks:
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for i, blk in enumerate(self.blocks):
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x = blk(x, c, edge_index, edge_attr=edge_attr)
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||||
if plot_results:
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||||
x_ = self.dec(x)
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||||
plot_results_fn(x_, pos, _, batch=batch)
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||||
if plot_results:
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||||
x_ = self.dec(x)
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||||
plot_results_fn(x_, pos, i * _, batch=batch)
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||||
return self.dec(x)
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Reference in New Issue
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